把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
海关风险保证金保函需填写和提交的材料：
1．《开立海关风险保证金保函申请书》；
2．营业执照、身份证及复印件，法人代表证明书或法人授权委托书及复印件；
3．上年度财务报告（含资产负债表、损益表和现金流量表）原件，有条件的还应经财政部门或会计师事务所核准；
4．有权部门批准的企（事）业章程或合资、合作的合同或协议，验资证明；
5．实行公司制的企业法人需提供公司章程；公司章程对法定代表人办理信贷业务有限制的，需提供董事会同意的决议或授权书；
6．中国人民银行颁发的贷款证（卡）；
7．技术监督部门颁发的组织机构代码；
8．新客户还需提供印鉴卡、法定代表人签字式样。
银行保函的办理流程：
1、填写开立保函申请书并签章；
2、提交保函的背景资料，相关的保函格式并加盖公章，企业近期财务报表和其它有关证明文件；
3、落实银行接受的担保；
4、由银行审核后对外开出保函。
如何选择合适的银行保函？
费率比较
不同银行对于不同类型的保函收费标准可能会有所不同。因此，在选择银行时，需要对各家银行的收费标准进行比较，以选择惠的方案。
银行信誉度
在选择银行时，需要考虑其信誉度和声誉。只有选择信誉度高、声誉良好的银行才能有效地降低风险。