北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所与医院主体并称“一院三所”，成为集医疗、教学、科研、预防、国际交流五位一体的医疗科研联合体。眼科、耳鼻咽喉科为教育部批准的国家临床重点学科，变态反应(鼻过敏)科为原国家卫生和计划生育委员会批准的国家临床重点专科，中医眼科学为国家中医药管理局批准的中医重点学科。首都医科大学北京眼科学院和耳鼻咽喉科学院设在院内。医院设有世界卫生组织防盲合作中心和世界卫生组织防聋合作中心，附设北京同仁眼库(国际眼库协会会员)。
同仁医院历经百余年发展，凝练出“精诚勤和”的医院精神。在新的历史时期，同仁人将继承和发扬百年同仁优良传统，弘扬主流文化，苦练内功，精于内涵，团结一致，创新发展，努力为人民群众提供优质、、快捷的医疗服务。
青光眼科的临床诊疗技术长期居于国内水平，接近国际水平，这是我们多年来的特色，也是在学术界常年保持水平的重要基础。以恶性青光眼的诊断和为代表，在难治性青光眼的诊断和方面，始终处于国内水平，这方面的研究成果先后获得北京市科技进步二等奖和三等奖;在许多青光眼诊断技术的应用方面，青光眼科都走在国内同行的前列，比如应用二极管激光睫状体光凝技术各种难治性青光眼，应用激光小粱成型术早期开角型青光眼和残余性青光眼，青光眼白内障的联合手术，非穿通小粱切除手术，引流植入物手术、粘小管成型术、小梁消融术、全周小梁切开术先天性青光眼等。
角膜塑形镜门诊现设立在北京同仁医院崇文门院区东区一楼视光中心门诊，隶属眼科医学视光中心，现有医生6人，均为副高以上职称，专业擅长为眼视光医学及角膜病学，在复杂角膜屈光问题，近视眼防控，角膜塑形镜验配，硬性角膜接触镜(RGP)验配等领域具有丰富的临床经验。
服务人群：18-55岁的近视、散光、远视等屈光不正，希望通过手术矫正获得更好视觉体验的患者。